发文办理的程序包括起草、审核、签发、复核、印制、分发等。
学院公文一般由某项工作的主管部门负责起草，填写《天津医科大学临床医学院发文稿纸》，公文内容涉及到多个部门的，主办部门负责起草公文，相关部门会签。公文起草应当做到：
（一）符合国家法律法规和党的路线方针政策，完整准确体现发文意图，并同现行有关公文相衔接。
（二）一切从实际出发，分析问题实事求是，所提政策措施和办法切实可行。深入调查研究，充分进行论证，广泛听取意见。
（三）内容简洁，主题突出，观点鲜明，结构严谨，表述准确，文字精炼。
（四）文种正确，格式规范。人名、地名、数字、段落顺序准确；日期应写具体年、月、日；使用国家法定计量单位；引用公文应先引标题，后引发文字号。
（五）公文内容如涉及多个部门职权范围内的事项，起草部门必须主动与相关部门协商会签，征求意见，达成一致后方可行文。
（六）各部门要高度重视公文起草工作，不断提高公文起草水平，负责人应当主持、指导重要公文起草工作。
（七）公文的起草部门应当对公文的信息公开属性提出初步意见。
起草部门将公文文稿交学院办公室进行审核。审核的重点是：
（一）行文理由是否充分，行文依据是否准确，
（二）内容是否符合国家法律法规和党的路线方针政策；是否完整准确体现发文机关意图；是否同现行有关公文相衔接；所提政策措施和办法是否切实可行。
（三）涉及有关部门职权范围内的事项是否经过充分协商并达成一致意见。
（四）重要公文文稿是否按照有关规定经有关会议审议。
（五）文种是否正确，格式是否规范；人名、地名、时间、数字、段落顺序，引文等是否准确；文字、数字、计量单位和标点符号等用法是否规范。
（六）其他内容是否符合公文起草的有关要求。
经审核不宜发文的公文文稿，学院办公室将退回起草部门并说明理由；符合发文条件但内容需作进一步研究和修改的，由起草部门修改后重新报送。
起草部门将学院办公室审核过的文稿，报学院负责人签发。重要公文和上行文由学院主要领导或主要领导委托的负责人签发；涉及某一方面工作的公文，由分管院领导签发。纪要原则上由召集会议的院领导签发。签发人签发公文，应当签署意见、姓名和完整日期；圈阅或者署名的，视为同意。联合发文由所有联署单位的负责人会签。
审签和修改公文应当使用钢笔、毛笔和碳素、蓝黑墨水，不得使用铅笔、圆珠笔和纯蓝、红色墨水等。审批、修改时应当在公文纸左侧留出装订位置。
以学院党政名义制发的公文，由学院领导签批后，还需经过以下程序：
（一）复核校对。按照“谁拟稿、谁校对”的原则，起草单位必须对公文样稿认真校对，文稿内容原则上不再改动，特殊情况需作实质性修改的，应当报原签批人复审。学院办公室对公文的审批手续、内容、文种、格式等进行复核。
（二）登记管理。学院办公室对复核后的公文，应当确定发文字号、分送范围和印制份数并详细登记。
（三）印制核发。起草部门负责公文印制。公文印制要严格履行校对、制版、印刷、装订等程序，确保公文印制质量和时效。公文印制完毕，应当对公文的文字、格式和印刷质量进行检查后分发。根据工作需要和文件属性，公文印发后由起草部门负责上网发布。除上行文以及不予公开的公文以外，其他公文一般通过OA办公系统发布，不再以纸质形式下发。